你聽過用BLAST來搜索文獻么?就跟用洗衣機上網差不多……
2019-05-14 14:50   來源: 丁香通  點擊次數: 關鍵詞: BLAST 檢索文獻 PubMed

2元彩票中500万的 www.chmhhq.tw 要是就只知道一句話的話,是不是能搜到文獻呢?這個實際上就已經不能用普通的PubMed來進行搜索了。我們可以考慮使用BLAST來搜論文。

Blast你應該是知道的吧,就是用一段序列來搜索比對相類似的序列:

實際上文章中的句子,也是單詞序列有機的排列,所以就有了這么一種工具,Hello Blast:

一種搜索文獻的BLAST,我從PubMed上隨便找了篇最近的文章,選了摘要里的句子:

然后bia到Hello Blast里,去進行文獻的搜索:

和普通的BLAST一樣,對于句子的序列進行分析后,就獲得了相類似的文獻:

當然,還會呈現出這句句子與文獻間的相關系數。如果你熟悉PubMed的話,應該會說:哇,學霸君,PubMed的搜索里,也有一個類似的功能,就是通過文章中的關鍵詞,來顯示Similar articles:

但由于僅限于關鍵詞或者Mesh詞的搜索,得到的相似文獻可能與你要尋找的文獻沒什么特別大的關聯。

而Hello Blast還有點小功能,就是能分析搜到的這些相似論文的關鍵詞的詞頻,對相關的論文進行高頻詞的分析,讓你快速了解你搜的這句話里包含了多少相關的文獻信息:

甚至還能搜與這句話相關的作者,挖掘潛在的合作或者競爭者

要是有興趣的話,就來試試看吧,用一句句子來搜索文獻吧~

編輯: dxy_k71rapz2

 

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